Sitä vastoin useimmat eukaryoottiset DNA-ligaasit, yhdessä arkeisten ja bakteriofagien entsyymien kanssa, kuuluvat toiseen alaperheeseen; nämä entsyymit hyödyntävät ATP:tä kofaktorina.
Vaadivatko ligaasit ATP:tä?
Yleisesti käytetään kahta DNA-ligaasia. … T4-ligaasi vaatii ATP , kun taas E. coli -ligaasi vaatii NAD+ (nikotiiniamidiadeniinidinukleotidi on koentsyymi, joka koostuu 2 nt:sta, jotka ovat liittyneet fosfaattiryhmiensä kautta). Molemmat katalysoivat 5'-fosfaatti- ja 3'-OH-ryhmän liittymistä muodostaen fosfodiesterisidoksen.
Miksi ligaasit tarvitsevat ATP:tä?
DNA-ligaatioreaktion kaksi vaihetta
DNA-ligaatioreaktiossa itsessään on kaksi perusvaihetta. Ensinnäkin DNA-päiden täytyy törmätä sattum alta ja pysyä yhdessä tarpeeksi kauan, jotta ligaasi liittyisi niihin. … Jotta entsyymi voisi suorittaa lisäreaktioita, entsyymin aktiivisen kohdan AMP on täytettävä ATP:llä.
Mikä on ligaasien tehtävä?
DNA-ligaaseilla on olennainen rooli genomisen eheyden ylläpitämisessä yhdistämällä replikaation ja rekombinaation aikana ilmeneviä DNA:n fosfodiesterirungon murtumia sekä DNA-vaurioiden ja sen aiheuttamien vaurioiden seurauksena. korjaus. Kolme ihmisen geeniä, LIG1, LIG3 ja LIG4, koodaavat ATP-riippuvaisia DNA-ligaaseja.
Mitä ovat ligaasit toimivatko ne aktiivisesti vai passiivisesti?
DNA-ligaasi on aktiivinen DNA:n replikaation, korjaus- ja rekombinaatioprosessin aikana. Sitä käytetään laaj alti yksisäikeisten korjaustöissäkatkaisee elävien organismien dupleksi-DNA:n käyttämällä kaksoiskierteen komplementaarista juostetta templaattina, kun taas jotkin muodot voivat erityisesti korjata kaksijuosteisia vaurioita.
