Koska DdNTP:ssä on vetymolekyyli (-H) hydroksyyliryhmän (-OH) sijasta, joka on kiinnittynyt sen deoksiriboosin 3'-C:hen, se ei voi sitoutua sisään tuleviin nukleotideihin. Siksi DdNTP:iden lisäämistä DNA:n replikaation aikana voidaan käyttää synteesireaktion lopettamiseen.
Miksi DNA-synteesi pysähtyy, kun ddNTP liitetään kasvavaan DNA-juosteeseen?
Jos lisätty nukleotidi on "dideoksinukleotidi" (Kuva 6.29), kasvavan juosteen 3'-päässä on nyt H OH:n sijaan. Tämä estää ylimääräisten nukleotidien lisäämisen; eli DNA-synteesi in vitro pysähtyy tässä vaiheessa.
Kuinka ddNTP lopettaa DNA-synteesin?
Kun ddNTP liitetään nukleotidiketjuun, synteesi päättyy. Tämä johtuu siitä, että ddNTP-molekyylistä puuttuu 3'-hydroksyyliryhmä, jota tarvitaan muodostamaan linkki ketjun seuraavan nukleotidin kanssa.
Miksi DdNTP:t lopettavat replikointiprosessin?
Entsymologian laboratoriomenetelmät: DNA
Dideoksinukleotidi trifosfaatit liitetään helposti kasvavaan DNA-ketjuun, mutta niiltä puuttuu 3'-hydroksyyliryhmä, joka tarvitaan ketjun jatkumiseenja lopettaa tehokkaasti polymeroinnin.
Miksi dideoksinukleotidit pysäyttävät DNA:n replikaation?
Näistä ddNTP:istä puuttuu 3'-OH-ryhmä, jota tarvitaan fosfodiesterisidoksen muodostumiseen kahden välillänukleotidit, mikä saa DNA-juosteen pidentymisen pysähtymään, kun ddNTP:tä lisätään.
