Agaroosigeelejä käytetään DNA:n kanssa biomolekyylien suuremman koon vuoksi (DNA-fragmentit ovat usein tuhansia kDa). Proteiinigeeleille polyakryyliamidi antaa hyvän resoluution, koska paljon pienempi koko (50 kDa on tyypillinen) sopii paremmin geelin tiukempiin molekyylien välisiin rakoihin.
Mitä eroa on agaroosigeelielektroforeesilla ja polyakryyliamidigeelielektroforeesilla?
Pääasiallinen ero agaroosin ja polyakryyliamidin välillä on, että agaroosia käytetään agaroosigeelielektroforeesissa (AGE) pääasiassa DNA:n erottamiseen, kun taas polyakryyliamidia käytetään polyakryyliamidigeelissä. elektroforeesi (PAGE) pääasiassa proteiinien erottamiseen.
Miksi polyakryyliamidigeelit ovat parempia kuin agaroosigeeli?
Polyakryyliamidigeeleillä on seuraavat kolme suurta etua agaroosigeeleihin verrattuna: (1) Niiden erotuskyky on niin suuri, että ne pystyvät erottamaan DNA-molekyylejä, joiden pituudet eroavat vain 0,1 % (eli 1 bp 1 000 bp:ssä).). (2) Niihin mahtuu paljon suurempia määriä DNA:ta kuin agaroosigeelit.
Miksi polyakryyliamidia käytetään agaroosin sijaan proteiinien karakterisoinnissa?
Polyakryyliamidi ja agaroosi ovat kaksi elektroforeesissa yleisesti käytettyä tukimatriisia. … Agaroosilla on suuri huokoskoko ja se sopii nukleiinihappojen ja suurten proteiinikompleksien erottamiseen. Polyakryyliamidilla on pienempi huokoskoko ja se on ihanteellinenerottaa suurimman osan proteiineista ja pienemmistä nukleiinihapoista.
Miksi polyakryyliamidigeeliä käytetään?
Polyakryyliamidigeelielektroforeesia (PAGE) käytetään rutiininomaisesti proteiinianalyysiin, ja sitä voidaan käyttää myös alle 100 bp:n nukleiinihappofragmenttien erottamiseen. Nukleiinihapot analysoidaan tavallisesti käyttämällä jatkuvaa puskurijärjestelmää, jossa puskurin koostumus, pH ja huokoskoko ovat vakiona koko geelissä.
