Mistä DNaasi I -yliherkkyyskohtia löytyy ja mitä ne kertovat kromatiinin luonteesta? Nämä kohdat löytyvät eksoni-introniliitoksesta ja osoittavat mRNA:n katkaisukohdan silmukoinnin aikana. Nämä kohdat löytyvät satunnaisesti koko genomista, ja se tekee DNA:sta alttiita hajoamiselle.
Mikä on DNaasi I -yliherkkä kohta ja miten se vaikuttaa kromatiiniin?
Genetiikassa DNaasi I -yliherkät kohdat (DHS:t) ovat kromatiinin alueita, jotka ovat herkkiä DNaasi I -entsyymin katkaisulle. Näillä genomin tietyillä alueilla kromatiini on menettänyt tiivistyneen rakenteensa, mikä paljastaa DNA:n ja tekee siitä saatavilla.
Mitä DNase-yliherkkä sivusto ehdottaa?
Aktiiviset cis-säätelyelementit ovat yliherkkiä endonukleaasi-DNaasi I:n katkaisulle. DNaasi I -yliherkkien kohtien aiheet osoittavat mahdollista trans-aktiivisten tekijöiden läsnäoloa ja yhdistettynä DNaasi I:n kanssa katkaisutietoja voidaan käyttää väliaikaisten sääntelyverkkojen rakentamiseen.
Mikä on DNaasi-yliherkkyysmääritys?
DNaasi I -yliherkkyysmääritys (DHA) on ollut yli kahden vuosikymmenen ajan instrumentaali säätelydomeenien löytämisessä (11). Tämä menetelmä kartoittaa genomissa erilliset kohdat, joissa kromatiinin konformaatio tekee sen DNA:sta yliherkäksi endonukleaasi-DNaasi I:n (12) katkaisulle.
Mikä on nukleaasiyliherkkä kohta kromatiinissa?
Sisäänkromatiini, nukleosomivapaiden alueiden, jotka tunnetaan nukleaasiyliherkkinä kohtina, uskotaan edustavan "avoimia ikkunoita", jotka mahdollistavat tärkeiden cis-vaikutteisten DNA-sekvenssien paremman pääsyn trans-vaikuttaviin tekijöihin (katso viitteet.