BLASTia voidaan käyttää useisiin tarkoituksiin. Näitä ovat lajien tunnistaminen, domeenien paikantaminen, filogenian määrittäminen, DNA-kartoitus ja vertailu. BLASTin avulla voit mahdollisesti tunnistaa lajin oikein tai löytää homologisia lajeja.
Mihin BLASTia käytetään?
BLAST on tietokonealgoritmi, joka on käytettävissä verkossa National Center for Biotechnology Information (NCBI) -sivustolla sekä monilla muilla sivustoilla. BLAST voi kohdistaa ja verrata kyselyn DNA-sekvenssiä nopeasti sekvenssitietokantaan, mikä tekee siitä tärkeän työkalun jatkuvassa genomitutkimuksessa.
Mikä on BLAST-tekniikka?
BLAST-tekniikka on Albert Barneton kehittämä valituksen ratkaisumenetelmä . Muistomerkki tarkoittaa uskoa, kuuntelua, anteeksipyyntöä, tyydytystä ja kiitosta (taulukko 1). 6. Tässä artikkelissa kuvataan sen hyödyllisyyttä potilaiden hoidossa ja kliinisenä opetusvälineenä.
Kuinka BLAST toimii DNA:ssa?
Kuinka BLAST toimii? BLAST tunnistaa homologiset sekvenssit käyttämällä heuristista menetelmää, joka aluksi löytää lyhyet vastaavuudet kahden sekvenssin välillä; menetelmä ei siis ota huomioon koko sekvenssiavaruutta. Ensimmäisen osuman jälkeen BLAST yrittää aloittaa paikalliset tasaukset näistä alkuotteluista.
Miksi BLAST on nopeampi kuin Fasta?
Algoritmin ajonaikaisen monimutkaisuuden kann alta BLAST on nopeampi kuin FASTA hakeemalla vain merkittävimmät kuviotsekvenssit. BLASTin ja FASTAn herkkyydellä (tai tarkkuudella) on taipumus olla erilainen nukleiinihappo- ja proteiinisekvensseille (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
