Peptidisidokset ovat tasomaisia, trans-konfiguraatioita ja ne käyvät läpi hyvin vähän pyörimistä tai kiertymisen amidisidoksen ympärille, joka yhdistää yhden aminohapon α-aminotypen karbonyylihiileen seuraavasta (kuva 4-1).
Miksi pyöriminen peptidisidoksen ympäri on kiellettyä?
Miksi pyörittäminen peptidisidoksen ympäri on kiellettyä ja mitä seurauksia kiertämisen puutteesta on? Peptidisidoksella on osittainen kaksoissidosluonne, mikä estää pyörimisen. Tämä rotaation puute rajoittaa peptidirungon konformaatioita ja rajoittaa mahdollisia rakenteita.
Voivatko peptidisidokset taipua?
Koska polypeptidin runko, jota peptidisidokset pitävät yhdessä, on joustava ("kaikkien sidosten ympärillä tapahtuvan pyörimisen" vuoksi), ketju voi taipua, kiertyä, ja taipua hyvin suureksi valikoimaksi kolmiulotteisia muotoja.
Ovatko peptidisidokset palautuvia?
Vaikka peptidisidoksen muodostuminen voidaan kääntää lisäämällä vettä (hydrolyysi), amidisidokset ovat erittäin stabiileja vedessä neutraalissa pH:ssa ja peptidisidosten hydrolyysissä soluissa on myös entsymaattisesti kontrolloitu.
Onko peptidisidoksilla suuntaus?
Vaikka peptidiryhmän geometria on kiinteä, alfa-hiilen kummallakin puolella olevat sidokset voivat pyöriä. Tämä mahdollistaa joustavuuden peptidirungossa. … Proteiinin aminohapposekvenssillä on suuntaus taiorientaatio, jonka määrittelevät ketjun päissä olevat funktionaaliset ryhmät.
